雷區(qū)一
酸性物質(zhì)適合做負離子檢測，所以流動相偏堿性較合適，促使其解離，堿性物質(zhì)適合做正離子檢測，流動相中適當?shù)募尤胨?，促使其形成正離子，流動相中適當加一些醋酸鈉(或者醋酸銨)，可形成加鈉的正離子或者加銨的正離子。
1、推薦使用的流動相和添加劑：
① 有機溶劑：反相：乙腈/甲醇/乙醇/異丙醇/二氯甲烷；正相：吐侖/己烷/苯/環(huán)己烷/四氯化碳
② 緩沖液：乙酸銨/甲酸銨
③ 酸：甲酸/乙酸/三氟乙酸(正離子)
④ 堿：氨水
2、不推薦使用/盡量不用的：
① 有機溶劑：四氫呋喃
② 緩沖液：磷酸鹽/檸檬酸鹽/碳酸鹽
③ 酸：硫酸/磷酸/鹽酸/高氯酸/磺酸
④ 堿：季胺/強堿/三乙胺
⑤ 其他：清潔劑/表面活性劑/離子對試劑/不揮發(fā)的鹽
雷區(qū)二
糖苷類的物質(zhì)在做FAB和esi(+)時，峰往往比峰要強，此為經(jīng)驗，原因只是推測可能和天然產(chǎn)物的提取過程有關(guān)；鹽類化合物如鹽酸鹽、硫酸鹽在質(zhì)譜中酸的部分一般不會出現(xiàn)；二羧酸鹽(esi負離子模式)除了分子離子峰外，會出現(xiàn)連續(xù)掉44的兩個峰，為失去羧酸根的離子，這三個峰非常特征，但是會受錐孔電壓的影響，調(diào)低電壓譜圖會更漂亮。
雷區(qū)三
胺類物質(zhì)做esi質(zhì)譜時要注意進樣量要少，因為很容易離子化，不易沖洗干凈，會影響后面樣品的測定。像三乙胺在液質(zhì)聯(lián)用時不能用于調(diào)節(jié)流動相pH值。若不慎引入三乙胺，在正離子檢測時總會出現(xiàn)很強的102峰(三乙胺的)。
雷區(qū)四
質(zhì)譜用水一般用娃哈哈純凈水之類的就很好；質(zhì)譜用甲醇和乙腈，換用了很多品牌，發(fā)現(xiàn)Merck的還是稍微好一些；Finnigan用的氮氣不一定要用到液氮瓶，用普通的鋼瓶氣就可以了，可能還省錢些；建議大家買一個好一點的手電筒和一個放大鏡，手電筒用來看源里面，放大鏡看你割的毛細管平整。
雷區(qū)五
質(zhì)譜的基線其實跟液相的紫外檢測器和熒光檢測器一樣，基線高的原因不外乎內(nèi)部和外部的原因。
① 你選擇的流動相在質(zhì)譜的響應(yīng)比較高，比如水相比較多的時候，噪音比較大些；還有如果鹽含量比較大的時候，噪音更大些。
② 檢測器的靈敏度越高的時候，噪音應(yīng)該越高。如果質(zhì)譜的污染比較嚴重時，基線肯定比較高。比如離子阱檢測器，用得久了，阱中的離子就會增多，一方面降低了質(zhì)譜的靈敏度，另一方面增加了基線噪音。
③ 質(zhì)譜的基線很多時候還跟你選擇的離子寬度有關(guān)。比如你作選擇離子掃描的時候，基線就低些。你作選擇反應(yīng)掃描的時候，離子寬度不要選得太寬，太寬噪音就高些。
④ 多級質(zhì)譜一般做二級或三級質(zhì)譜，基線噪音就低很多。
雷區(qū)六
質(zhì)譜維護經(jīng)驗交流：做樣前-檢查氮氣，流動相，質(zhì)譜儀的真空度，毛細管溫度…
⑤ 最好不用直接進樣(容易污染離子源)；
⑥ 做聯(lián)用時最好分流(a可以使用常規(guī)柱，b縮短分析時間，c延長質(zhì)量分析器壽命)；
⑦ 最好使用在線切換閥，降前每個樣品的前后1-2分鐘的流動相切入廢液(避免樣品中的鹽進入質(zhì)譜，做Sequence時可以把平衡柱子的流動相切入廢液)；
⑧ 開始聯(lián)用前，直接運行質(zhì)譜數(shù)分鐘，可以先將溫度(毛細管溫度和離子源溫度(APCI)加熱到預設(shè)定值(如果是APCI源還可以避免將燒掉heater，太貴了，最好別燒)；
⑨ 待機時將切換閥置于waste，避免剛開液相時將流動相打入離子源；
⑩ 關(guān)機前毛細管的溫度先降下來，穩(wěn)定一段時間后再關(guān)閉電源，避免風扇停止轉(zhuǎn)動后毛細管外圍的熱量向里擴散，容易引起內(nèi)部線路及電子元器件老化加速；
? 每天清理毛細管口外部，擦洗干凈，每次停機時注意清洗Skimmer，用無塵擦拭紙，kimberly那種；
? 如果用的是鋼瓶而且天天做樣的話，將兩個鋼瓶并聯(lián)，當然，一月不做一次的話就算了；
? 做定量時注意離子源噴針的具體位置，否則標準曲線就不能用了；
? 不要不經(jīng)過柱子分離進行定量分析，結(jié)果不可靠(競爭性抑制目標分子離子化)；
? 如果是負離子檢測的話，可以相流動相中加入少量異丙醇；
? 不要使用不揮發(fā)性鹽，如果使用揮發(fā)性鹽，但濃度不要超過20mmoL/L；
? 需要使用酸的情況下可以用甲酸，乙酸，三氟乙酸可以用，但能用甲酸或乙酸時就別用TFA；
雷區(qū)七
理論上液質(zhì)聯(lián)用禁止使用任何不揮發(fā)性的緩沖鹽，如果需要盡量使用諸如乙酸氨等揮發(fā)性鹽，濃度不要超過20mmoL/L。
對于不揮發(fā)性的緩沖鹽，如果你的儀器有吹掃捕集的話也可使用，但一定要小心。萬不得已也不要用，首先有不揮發(fā)鹽是得不到好的離子流的，其次鹽留在質(zhì)譜中很難除掉，除非停機清洗，不然一直會影響其他樣品的分析。
可以找質(zhì)譜友好的條件來做液質(zhì)聯(lián)機，例如色譜條件為20mM磷酸鹽的水/乙腈流動相，做液質(zhì)聯(lián)機的時候就可以用醋酸銨代替，然后用醋酸調(diào)節(jié)pH值與磷酸鹽的一致即可。
除了難揮發(fā)的鹽，三乙胺、表面活性劑、還有高濃度(>0.5%)的TFA，都對質(zhì)譜不好，液質(zhì)聯(lián)用的流動相中應(yīng)該避免。
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